Auto-entrepreneur en arrêt maladie : quels droits aux indemnités journalières de la Sécurité sociale ?

J'ai été au chômage depuis mon licenciement pour faute grave en octobre 2011. J'ai créé une auto-entreprise bénéficiant de l'ARCE le 1er janvier 2012. J'ai été en arrêt pour maladie professionnelle fin septembre 2012 (rechute... opération de la coiffe des rotateurs, la date de depart de ma maladie porfessionnelle est juillet 2009). J'ai radié mon auto-entreprise le 30 novembre 2012. Actuellement en arrêt maladie professionnelle jusqu'au 8 février 2013, je ne pourrais me réinscrire à Pôle emploi qu'après cette date. Ma question est la suivante : ai-je droit à des indemnités journalières de la Sécurité sociale et si oui comment proceder ?